吾人此生所承受的种种痛苦，皆由于过去世所造作的恶业所感召；恶业亦能障碍行者无法证得各种道次第之证量，因此，修行之首要课题，即为净除罪障。
　　行者欲藉由修持而净除罪障，须具足四力（依止力、对治力、拔除力、防护力）方能成办。
　　吾人造作恶业的对象，不外乎上师三宝与有情众生；是故，欲忏悔罪障，须对上师三宝具足信心而作皈依，相信依止上师三宝不可思议的功德，终能将行者无量无边的罪业予以净除；此外，行者对于有情众生应生起慈悲心与菩提心；若能具足此二种要素，行者的忏悔将具足极大的力量。
　　具足依止力后，行者须修持对治力以逐步净除罪障，对治力的修持方法，最主要有两种：
　　一、念诵三十五佛礼忏法并行大礼拜——此为显教忏除罪障之修法，行大礼拜时，行者可依自身状况，调整礼拜的速度，不须强求与念诵佛号的速度相同，本法又名《菩萨堕忏》或《三聚经》，是极为殊胜的忏悔罪障修持法门。
　　二、修诵金刚萨埵百字明咒——此为密法之忏除罪障修法，可结合大礼拜修持，亦可不行大礼拜，而以观修金刚萨埵并念诵百字明咒的方式行之，金刚萨埵百字明咒对于净除罪障具有极大的力量，因此，密乘行者每日至少须修诵金刚萨埵百字明咒廿一次，以达到忏悔罪障之目的。
　　行者精进修持依止力与对治力后，若能对自身过去所造作的恶业，生起极为后悔的心念，如此，将能使行者忏悔罪障的修持更为坚固有力。如何生起后悔的心念？经典中有如是譬喻：例如有三个人均吃下有毒的食物（造作恶业），其中一人已死亡（沦堕恶趣），一人正因毒性发作而痛苦万分（濒临死亡，即将堕入恶趣），而自己虽毒性尚未发作，但看到其它二人的悲惨际遇，必定对自己吃下毒物的行为感到极为后悔，并亟思求得解毒之法。如是观修能将行者的罪障予以拔除，达到忏除罪障的目的。
　　行者往昔所造作的罪业虽得以净除，但若未能惕励自己从此制止、永不再犯，仍然持续造作恶业，则罪障将永远无法完全净除；因此，须修持防护力，警惕自己勿再造作恶业。惟此目标并非一蹴可及，行者须时时省察自己的心念，避免继续造作恶业；若已造作恶业当生起极为强烈的忏悔心，逐步将恶习断除，如此，必能达成不再造作恶业之目标。
　　修行的另一个重要课题为积聚资粮，行者欲证得圆满佛果必须累积圆满的福德资粮与智慧资粮，福德资粮若未能圆满，智慧资粮亦无法圆满。在四加行法中，修持“供曼达法”为累积资粮与净除业障的殊胜法门，《菩提道次第广论》中提及：若能配合七支供养修持供曼达，将能累积极为殊胜的福德资粮。
　　噶当派的祖师“贡巴瓦”曾因进入甚深禅定，而忽略外事的供养，以致曼达盘布满灰尘，为仲敦巴尊者所见，尊者呵斥道：“昔日阿底峡尊者修习禅定时，仍每日三次修持供曼达，汝之禅定境界是否能胜过尊者，为何使曼达盘布满灰尘？”贡巴瓦闻后甚感惭愧，从此之后，每日精进修持供曼达，最后获得殊胜的成就。
　　宗喀巴祖师本已具足成就，无须再修持积聚资粮的法门，但大师为后世行者能有学习的典范，因而以石头作成的曼达盘，精进修持供曼达，乃至肉穿见骨。
　　修持供曼达法时，首先以左手握住曼达盘，掌心须握有宝石或米（不可空手），以右手腕根部（此部位有菩提心脉）向外摩擦曼达盘三圈（顺时钟）以净除罪障，再向内摩擦三圈（逆时钟）以获致诸佛菩萨的加持。供曼达法的仪轨可分为卅七堆、廿五堆与廿三堆等三种，其中廿三堆的修法为宗喀巴祖师所传。无论修持何种供曼达仪轨，行者所获福德资粮的多寡，并非决定供养物的大小及珍贵与否，而是决定于行者的心量。
　　例如，释迦牟尼佛住世时，护持佛教不遗余力的“阿育王”，在久远劫前，毘卢遮那佛住世的时代，尚是一位孩童，一日，毘卢遮那佛经过此孩童的身旁，孩童想要供养佛陀，却苦于身边无任何财物，遂随手抓起一把沙土，并将沙土观想为黄金，虔敬发心供养；由于小孩出于一片至诚而作供养，以此因缘，小孩在释迦牟尼佛住世的时代，便成为护持佛教最力的国王。因此，行者修持供曼达法时，应修正意念与动机，以诚敬的发心与广大的心量而作供养，必能累积殊胜的福德资粮。