伦珠尊珠，生于1874年，比帕邦喀活佛和喜饶嘉措大师都稍大一点，不过成名却稍晚。他的经典学问逐步冒尖为人所知的时候，正是十三世嘉瓦尊者从印度流亡回来，开始着手整顿格鲁派的年代。格鲁派初兴之时，是以改革派的面目出现的。宗喀巴当年就是有感于萨迦、噶举等旧教派日益腐败，胡作非为，才发愿创建新派，实行宗教改革，以先显后密，严守戒律，崇尚苦修等等为标榜，才迅速赢得了藏区广大民众的信仰和拥护的。但格鲁派如同其他一切封建政教体系一样，都缺乏一种自我监察自我更新的内部调节机制，年深月久，暮气渐重。到了十三世嘉瓦尊者的时代，也已经腐败得可以了。整个格鲁派、戒律松弛，政教两界，贿赂公行。这就使得十三世嘉瓦尊者震怒异常。他采取了许多措施，力求肃除弊端，整顿学位考评制度，以求根本上重新振兴格鲁派。在这个大背景下，伦珠尊珠才得以脱颖而出。
　　伦珠尊珠是日喀则地区南木林人，家境贫寒，自幼在色拉寺吉扎仓出家。因为勤奋刻苦，在佛学上根基扎实，到40岁左右渐渐出了名。十三世嘉瓦尊者那时常到三大寺考查众僧的学业，亲自主持他们的辩经，对伦珠尊珠的学问和操行有深刻的印象。十三世嘉瓦尊者的首任经师，是西藏很有名的普布觉活佛。普布觉活佛原是十二世嘉瓦尊者的经师。上辈尊者年轻轻夭折后，清廷大皇帝又命他继任这辈尊者的经师。他把十三世嘉瓦尊者从5岁时带大，师徒俩情逾父子，感情十分深厚。一直等到十三世嘉瓦尊者长大成人掌稳了政权后，这位70高龄的老经师才心满意足，溘然撒手人世。身后留下的最珍贵的东西，便是他精心收藏起来的十三世嘉瓦尊者幼时初学书法时的作业手迹，和学算术时当筹码用的染了色的长长短短的木棍及各色各样的石子。十三世嘉瓦尊者痛失恩师，哀恸异常。老经师身后的一切，从颂经超度，建造灵塔，到寻访灵童，他都一手操办，不愿别人插手。据说连经师灵塔前放供品的矮藏柜上的五彩图案花纹，都是嘉瓦尊者一笔一笔亲手绘描的。老经师的转世灵童找到后，自然受到十三世嘉瓦尊者无微不至的破格关怀。每年“雪顿”节罗布林卡演藏戏，尊者观赏藏戏时的楼台法座近旁，必设有小灵童的座位。十三世尊者很相信活佛转世这一套，他完全是把小灵童真的当成了自己老经师的转世化身。在灵童很小时起，尊者就一直恭恭敬敬尊称他为“荣增仁波且”，意为“经师大活佛”，一如老经师生前。于关切爱护中，始终带着点祟敬爱戴。
　　灵童渐渐长大，得给他找一个经典学问出众，操行道德又高尚的好经师了。西藏但凡实行转世制度的教派，对小活佛的教育，是说什么也不敢放松的。因为在教派林立，竞争激烈的环境里，寻找来的灵童有没有出息，关系到该教派或该寺院的兴衰存亡。十三世嘉瓦尊者为此极费踌躇。最后，他竟破例选定了当时还没有考上拉让巴格西的伦珠尊珠。
　　不过，他这一选择，倒也并没有招致拉萨社会上任何人的非议。伦珠尊珠那时经典学问之好，有口皆碑，已为各方面所公认。大家心里都明白，他之所以还不是拉让巴格西，完全不是因为学问不够，而是因为他实在太穷，放不起布施，更出不起申请考格西时种种繁琐程序中必出的大量请托花费。
　　不过，既然荣任了普布觉大活佛的经师，没个拉让巴格西的头衔，于各方面的面子上，也实在总有点不那么好看。伦珠尊珠在各方面善意的敦促下，硬着头皮开始着手办理有关事项。五部大论他早已精通烂熟，各级考试他向来名列前茅。麻烦的是，每通过一道程序后，都必须向本康村乃至扎仓放一回布施以示同庆。西藏学经僧人，主要集中于哲蚌、色拉两寺。这两个寺院都大得吓人。一个康村几百人，一个扎仓上千乃至两、三千人。放一回布施，哪怕仅仅是茶饭，所耗钱财也不是小数。伦珠尊珠当了几十年喇嘛，什么经都会念，就是不会念捞钱经。真正是一贫如洗，囊中羞涩至极。靠临时化缘募捐，勉强照例行事，可实在是力所不及，寒酸得不行。结果当时拉萨老百姓就传出了这样的民谣，说：“伦珠尊珠的能耐真大，讲经讲得象流水一样，可布施的茶饭啊，也象清水一样稀里晃荡。”
　　这事让十三世嘉瓦尊者知道了，就传谕让他到罗布林卡去一趟。伦珠尊珠垂头丧气，穿着一袭朽旧不堪、打着不少颜色不一的补丁的僧袍袋装，忧容苦涩，忐忐忑忑，来到佛爷跟前。当时尊者身边的高级僧官，穿的都是从印度进口的赭红色高级英国毛料做的僧袍，不过为了表示佛门的俭朴清贫，都用同样的料子，在崭新的僧袍上打上几个精致的补丁。跟这些人比起来，伦珠尊珠活象灰鸦落在五色锦鸡群中，寒酸得更连头也抬不起来了。他知道自己放布施时扎仓众僧怨言不少，大宝佛明察秋毫，一定早已知情，耽心不知佛爷将怎么惩处他呢。
　　不料嘉瓦尊者一见到他，想起那首民谣，就忍不住笑起来。那首民谣讽刺味很足，用藏语唱起来，非常滑稽可笑。嘉瓦尊者越想越觉滑稽，笑得在法座上前仰后合，连眼泪都笑了出来。好半天，他才止住笑，指着伦珠尊珠说:“学僧伦珠尊珠，你可听见拉萨百姓唱你的民谣了没有?”“禀告大宝佛爷，我，这，这个小僧不曾听见。”
　　伦珠尊珠茫然瞪大眼珠，带几分惶惑又带几分紧张。他属于那种死守经堂，轻易不迈出山门一步的苦学僧人，对外间的任何事情、消息，都闭塞得很。不过他也不笨，自忖老百姓如果编歌谣唱他，那十之八九不会有什么好话。窘急之下，脑门马上开始泌出汗珠了。尊者带笑地把民谣念给他听，把这个穷到骨头的高僧窘得脸耳紫胀，都快哭出来了。尊者见了老大不忍，忙正色劝慰道：“你看你，着急什么呀。我叫你来，又不是想奚落你。说实在的，对一个普通出家人来说，贫寒不为耻辱。你又不是活佛，没自己的拉让私产，不过是一介寒僧，两手空空，六根清净。你既然有本事把经讲得象流水一样，当然放的布施也只好象清水一样稀薄了。自古以来，出家人就是这样，凡埋头于经典学问的，自然不可能去挣得财产;而能挣得财产的人，也就不可能真正钻研好经典学问，这两者向来不可兼得。”嘉瓦尊者说毕，当场就派人把普布觉活佛拉让的管家和色拉寺吉扎仓的堪布找来，当着伦珠尊珠的面，对他俩吩咐说：“伦珠尊珠是三大寺第一流的经学人才，将来前途不可限量，是佛门的装饰之宝。现在他考格西没钱，你们两家都要切实承担起责任来。我看，就一家出一半费用吧。”
　　西藏的僧人，团体意识很强。谁的寺籍在哪个寺院哪个扎仓，一生都与之保持千丝万缕的联系。彼此之间，当然也就承担着一定的责任和义务。有佛爷亲口发话，再加上伦珠尊珠的声望影响也已到了火候，普布觉拉让和吉扎仓责有所归，自然都没话可说，从各自的财库中拿出了一半赞助。
　　可那时，哲蚌寺人多势众，势力最大。十三世嘉瓦尊者当时的总堪布、正副经师，都出身于哲蚌寺。有资格在传昭法会上任拉让巴格西考评官的，当然也以哲蚌寺的堪布大喇嘛居多。结果录取名单公布时，伦珠尊珠虽然也傍上有名，却屈居第二。拉让巴格西的第一名给了哲蚌寺的学僧扎西郎加。嘉瓦尊者听到禀报后好生奇怪，心想莫非我看走了眼，三大寺学经僧中还有比伦珠尊珠经学更好的人才?于是，便将他俩一起叫到自己跟前，请自己的两位经师、7位侍读高僧一同参加，亲自主持他俩进行一场辩经。结果发现此人在经学造诣上，比伦珠尊珠差得好远。十三世嘉瓦尊者勃然大怒，当即将名次改了过来，并且把几位主事大堪布叫来，一个个骂得狗血淋头：“混账东西，你们这是干什么?拿着佛门大典、政教大业当儿戏?难道考格西不是考经典学问，而是考人情关系、考山头势力?照说，按你们的循私舞弊行为，我完全应该将你们撤职拿办，发配到恶远蛮荒之地流放才对。这次看在你们是初犯份上，我暂且饶了你们，每人罚黄金五两，再到罗布林卡里每人罚种柳树100棵，并由省噶(嘉瓦尊者的内侍机构)发文，昭告全藏各寺，以示薄惩。如果今后再发生此类弊端，我就把你们一个个都发配到不见天日的地方终身流放。”
　　从此以后，十三世嘉瓦尊者还作出规定，凡所有三大寺推荐参加考拉让巴格西的学经僧，都要先到布达拉宫大经堂来，在尊者亲自主持下，举行资格会考。考官是尊者的荣增(经师)和七大村晓(侍读高僧)，考试的办法仍是辩论，即轮流由一个应考僧人立宗答辩，其他应考僧人交相问难，以较量学问高下。这样一来，幕后的送礼请托虽然仍难杜绝，但一来各大考官都是嘉瓦尊者的经师侍读，跟尊者朝夕相见，位尊望重，还不至于象别的堪布那样贪鄙无忌；二来有尊者亲自当场监督，要作弊也玩不出多大手脚。
　　正是在十三世嘉瓦尊者这样的大力整顿和倡导下，西藏格鲁派寺院的学风，一度有所端正，终其一生，西藏的宗教文化也有了相当的繁荣发展。而伦珠尊珠作为这种背景下涌现出来的寺院经学正统的杰出代表，也受到西藏僧俗社会，尤其是寺院经学正统力量的高度推崇。他考上拉让巴格西第一名之后，除担任普布觉活佛的经师之外，又进下密院继续进行密宗方面的修行研究，名望越来越大，门生子弟遍及拉萨各大寺。1940年左右，他的资历也熬到份上了，终于顺理成章地当上了第九十四任甘丹池巴。不过，甘丹池巴尽管宗教地位至高无上，但除非在极端危急的情况下，要抬出他来出任摄政以维系人心之外，这位名义上的格鲁派法王，实际上一向是被排斥在西藏地方政教权力核心之外的。
　　1947年西藏的亲英分裂势力，逮捕了爱国倾向中央的前摄政热振活佛，又调动数千藏军，用英国人提供的火炮，轰击镇压想劫救热振活佛的色拉寺僧众，最后，悍然违抗当时的南京中央政府要求保护热振活佛的指示，惨无人道地下毒杀害了热振活佛。许多正直的宗教界人士，都觉得心里堵得慌，不约而同找到他们的师尊伦珠尊珠。其时身为格鲁派法 王的甘丹池巴伦珠尊珠，却丝毫无力去影响大局，只好垂泪对徒众说：“这是劫难啊，佛门圣教的劫难，雪域众生的劫难。”第二年，这位75岁高龄的一代高僧，就在抑郁忧愤中溘然谢世了。
　　据他的弟子们回忆，这位位尊望隆的大经师，尽管生性有点古板拘谨，却并不偏狭。据说，他开初对帕邦喀活佛颇有点看法，认为后者治学不够严谨。经学根基不够扎实，不过凭小聪明哗众取宠而已，颇有点野狐禅的嫌疑。还禁止过自己门下的弟子去听帕邦喀活佛讲经。可是后来，因为各方面都盛赞帕邦喀讲经讲得好，他疑疑惑惑，亲自悄悄跑去听了后者的几次讲经，回来后颇为感慨，对弟子们说：“帕邦喀活佛的因明确实是不错。”从此再也不禁止弟子们去听讲经了。
　　他担任甘丹池巴后，年年都要按惯例，以宗喀巴法座继承人的身份，主持拉萨传昭法会。有一年，色拉寺吉扎仓的僧众跟西藏地方政府闹意见，打算鼓动大家都不去参加，把当年的传昭法会给搅黄。因为他也是色拉寺吉扎仓出身的，吉扎仓就派人来请求他支持，要他也拒绝主持该年的传昭法会。他其实对吉扎仓僧众也有同情之处，但权衡再三，还是采取了顾全大局的做法，婉言解释道：“我是整个格鲁派的甘丹池巴，不是吉扎仓一个扎仓的甘丹赤巴。这样的大事，我怎么能擅自不参加呢”？
　　西藏至今还有一些活着的高僧是他的弟子，提起他来，总是充满崇敬向往之情。